Trong những năm đầu, trường được đặt tại cơ sở cũ của Phòng Giáo dục huyện, khuôn viên chật hẹp, phòng ốc không đồng bộ lại nằm sát quốc lộ, sát sông và sát chân cầu nên việc dạy học của trường đã gặp không ít khó khăn. Hội đồng sư phạm nhà trường đã từng bước khắc phục khó khăn để dần khẳng định mình qua chất lượng dạy học, qua kết quả các kỳ thi học sinh giỏi, thí nghiệm thực hành và các hoạt động do ngành tổ chức. Trường THCS Quang Trung được công nhận là trường tiên tiến xuất sắc, được Ngành tặng cờ dẫn đầu thi đua .